《秘书2002》故事讲述了Lee Holloway（玛吉·吉伦哈尔 Maggie Gyllenhaal 饰）生活在一个不和谐的家庭中，从小就展现出自毁倾向。经过一段时间的精神治疗后，她试图重新融入正常生活。为了改变自己的生活，Lee学会了打字，并在一家律师事务所找到了一份打字员的工作。起初，Lee的打字技能并不完美，她的雇主E. Edward Grey（詹姆斯·斯派德 James Spader 饰）发现了这一点。Grey将Lee叫到办公室，为了让她铭记错误，他展开了对她的性虐待，让Lee趴在书桌上。然而，这种特殊的互动逐渐使两人之间产生了一种奇妙的情感，也有助于减轻Lee的自毁倾向。
Lee渐渐爱上了Grey，但Grey却因为自己的奇癖而感到羞怯，最终解雇了Lee。在此时，Lee的男友Peter（杰瑞米·戴维斯 Jeremy Davies 饰）向她求婚，她接受了。然而，在婚礼当天，Lee却选择逃到了Grey的办公室，展开了一段令人意想不到的冲突和发展。在这个故事中，人物之间的情感交织，使得整个情节充满了戏剧性和张力。
